Skoda Fabia 的全性安全性能可以通过以下方式得到保障。

在主动安全装备配置方面，保障它配备了常见的全性 ABS 和 EBD 等系统，还拥有同级别罕见的保障 MSR 发动机阻力矩控制系统和 CBC 弯道控制系统，能保证车辆在弯道、全性湿滑路面等状况下稳定行驶。保障此外，全性还有适合车道保持、保障行人/骑自行车者保护等功能，全性可检测即将发生的保障碰撞并发出警告和自动启动刹车。

在被动安全装备方面，全性前排燃爆预紧式安全带、保障前排双安全气囊、全性侧面安全气囊、保障可溃缩式转向柱、全性制动踏板保护机构、带有碰撞保护杆离合器踏板等，全方位保护乘员安全。同时，前部、窗帘和侧面安全气囊是标准配置，还可在后部指定膝盖和侧面安全气囊，Isofix 是后排两个座椅的标准配置，是前排乘客座椅的选装配置。

而且，斯柯达 Fabia 的承载式车身经过特别研发，与约束系统一起为驾乘提供更好的安全保护，发生碰撞事故时，车身结构能有效吸收撞击能量。

斯柯达 Fabia 在 C-NCAP 严苛的碰撞测试中夺得五星安全桂冠，其赛车运动部门推出的全新 Fabia RS Rally2 也采取了多项安全措施，比如车身两侧由座椅支架结构和附加杆连接，车门处有坚固的防滚支架，特制的赛车座椅、六点式安全带和头颈部支撑系统等，能更好地保证驾驶员和副驾驶的安全。

另外，Fabia Combi 全车系标配 6 气囊，ESC 电子行车稳定、ASR 加速防滑控制、HHC 升坡辅助等主动安全系统也是标准配备，还搭载有助于降低意外伤害的 MKB 二次碰撞预防系统，以及 XDS+主动式电子限滑差速器，能提升安全性和操控灵活性。